У меня не получилось ни удаление настроек из ХранилищеСистемныхНастроек, ни отключение свойства "РастягиватьПоВертикали" у элементов.
Пришлось смириться с одинаковым размером самой формы, и менять только видимость элементов. Чтобы форма не разъезжалась пришлось жестко задать размеры формы.