Когда идет сортировка по моменту времени, то фактически сортировка идет по: Дата, ТипДокумента, УникальныйИдентификатор. Сортировка по ТипуДокумента идет по времени добавления в конфигурацию(скорее всего по ИД метаданных).
Повлиять на это нельзя. Нужно просто это учитывать.
Решение задачи: отчет в СКД выводит список документов с значением реквизита Комментарий. Надо, чтобы пользователь мог не открывая документа по ссылке, добавить в комментарий текст "Проверено".